天気アプリのショートカットとは、ホーム画面に置かれているアイコンを長押しすると現れるショートカットメニューのことですね? そこには2つの都市/地域が表示されているので、それぞれ自分が望むものに変更したい、よく参照する都市/地域の天気情報をショートカットからすばやく開きたい、というお考えと推察しました。
そのショートカットに表示される2つの都市/地域は、右横に表示されているアイコンで見分けることができます。矢じりが現在地、ピンが「もっとも表示優先順位が高い登録地」です。前者は位置情報とリンクしているため、実際にiPhoneとともにその地へ移動するしかありませんが、後者は天気アプリで登録地の表示優先順位を変えれば任意の都市/地域に変更できます。
手順はかんたん。天気アプリを開いて画面右下にある「三」をタップし、現れた画面で希望する都市/地域を上から2番目の位置へドラッグすればOKです。次回天気アプリのショートカットを表示したときには、ピンのアイコンの行に上から2番目の位置へドラッグした都市/地域が現れるはずです。
なお、特定の都市/地域の天気情報をすばやく表示したければ、ウィジェットを用意するという手もあります。ホーム画面またはTODAY画面(ホーム画面のさらに左側にあるウィジェット専用画面)に好みの大きさの天気アプリウィジェットを作成し、アイコンを長押しして「ウィジェットを編集」をタップします。ウィジェットに登録できる都市/地域は1つですが、かんたんな操作で特定の都市/地域専用の天気予報ウィジェットを作成できますよ。