理研が全ゲノム解析で日本人の遺伝的起源と特徴を解明

WGSデータを使用した日本人集団構造結果。(A)サンプルが集められた日本の7地域。(B)コモンバリアントを基にしたPCA分析が行われ、参加者が集められた地域ごとに色分けが行われた。(C)レアバリアントに基づくPCA-UMAP分析が示されている。(B)と(C)では、1つ1つの点が個人を表しており、点と点との距離は遺伝学的な違いが反映されている。近い点ほど遺伝学的には近縁である。この2つの図では、出身地を元にした遺伝背景の違いにより、色分けして表示されている。(D)ADMIXTURE分析が行われ、3つの集団(K=3)に分けられた。沖縄以外の地域からはランダムに100人が選ばれ、沖縄からは全員(28人)がそれぞれ分析された。K1は沖縄、K2とK3はそれぞれ東北と関西で最も高い値が示されている(出所:静岡県立大Webサイト)