アップルは、iTunesの最新版としてバージョン9.0.3を公開した。Windows版およびMac OS X版の配信を開始している他、Windows Vista用64bit版として「iTunes 9.0.3 for Windows (64 bit)」も配布している。

iTunes 9.0.3では、「購入用パスワードを保存する」の設定内容が無視される問題、スマートプレイリスト/PodcastをiPodに同期する際に生じる問題、iPodを接続した際の認識に関する問題などが修正された他、安定性とパフォーマンスを向上。

Windows版の動作環境は、1GHz IntelまたはAMDプロセッサ、メモリ512MB以上、1,024×768以上のディスプレイ解像度、QuickTime 7.6.4、200MBの空きディスク容量。対応OSはWindows XP SP2以降/Vista/7(いずれも32bit)。iTunes 9.0.3 for Windows (64 bit)の場合は、Windows Vista(64bit)。

Mac OS X版の場合は、IntelまたはPowerPC G5、G4プロセッサ、メモリ512MB以上、1,024×768以上のディスプレイ解像度、QuickTime 7.6以降、200MBの空きディスク容量、Safari 4以降。対応OSはMac OS X 10.4.11以降。